Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

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Length 1,200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TRERF1Q96PN7 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
TRERF1Q96PN7 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
TRERF1Q96PN7 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRERF1Q96PN7 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRERF1Q96PN7 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRERF1Q96PN7 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRERF1Q96PN7 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRERF1Q96PN7 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRERF1Q96PN7 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRERF1Q96PN7 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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TRERF1Q96PN7 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
TRERF1Q96PN7 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
TRERF1Q96PN7 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
TRERF1Q96PN7 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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TRERF1Q96PN7 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
TRERF1Q96PN7 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
TRERF1Q96PN7 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRERF1Q96PN7 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRERF1Q96PN7 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
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TRERF1Q96PN7 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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TRERF1Q96PN7 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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TRERF1Q96PN7 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
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TRERF1Q96PN7 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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TRERF1Q96PN7 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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TRERF1Q96PN7 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRERF1Q96PN7 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRERF1Q96PN7 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRERF1Q96PN7 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRERF1Q96PN7 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TRERF1Q96PN7 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRERF1Q96PN7 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRERF1Q96PN7 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRERF1Q96PN7 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TRERF1Q96PN7 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
TRERF1Q96PN7 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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