Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
MALSU1Q96EH3 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
MALSU1Q96EH3 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC-1.1□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC-1.11□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC-1.11□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC-1.13□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
MALSU1Q96EH3 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
MALSU1Q96EH3 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
MALSU1Q96EH3 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
MALSU1Q96EH3 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
MALSU1Q96EH3 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
MALSU1Q96EH3 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
MALSU1Q96EH3 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
MALSU1Q96EH3 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
MALSU1Q96EH3 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 233.5 ms