Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ1

USP49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, humanhuman

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Length 688 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP49Q70CQ1 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
USP49Q70CQ1 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
USP49Q70CQ1 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
USP49Q70CQ1 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
USP49Q70CQ1 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
USP49Q70CQ1 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
USP49Q70CQ1 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
USP49Q70CQ1 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
USP49Q70CQ1 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
USP49Q70CQ1 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
USP49Q70CQ1 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
USP49Q70CQ1 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
USP49Q70CQ1 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
USP49Q70CQ1 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
USP49Q70CQ1 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
USP49Q70CQ1 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
USP49Q70CQ1 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
USP49Q70CQ1 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
USP49Q70CQ1 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
USP49Q70CQ1 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
USP49Q70CQ1 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
USP49Q70CQ1 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
USP49Q70CQ1 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
USP49Q70CQ1 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
USP49Q70CQ1 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
USP49Q70CQ1 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
USP49Q70CQ1 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
USP49Q70CQ1 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
USP49Q70CQ1 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
USP49Q70CQ1 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
USP49Q70CQ1 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
USP49Q70CQ1 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
USP49Q70CQ1 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
USP49Q70CQ1 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
USP49Q70CQ1 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
USP49Q70CQ1 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
USP49Q70CQ1 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.18
USP49Q70CQ1 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
USP49Q70CQ1 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
USP49Q70CQ1 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
USP49Q70CQ1 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
USP49Q70CQ1 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
USP49Q70CQ1 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
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USP49Q70CQ1 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
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USP49Q70CQ1 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
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USP49Q70CQ1 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
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USP49Q70CQ1 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
USP49Q70CQ1 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
USP49Q70CQ1 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
USP49Q70CQ1 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
USP49Q70CQ1 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
USP49Q70CQ1 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
USP49Q70CQ1 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
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USP49Q70CQ1 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
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USP49Q70CQ1 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
USP49Q70CQ1 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
USP49Q70CQ1 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
USP49Q70CQ1 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
USP49Q70CQ1 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
USP49Q70CQ1 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
USP49Q70CQ1 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
USP49Q70CQ1 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
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USP49Q70CQ1 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
USP49Q70CQ1 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
USP49Q70CQ1 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
USP49Q70CQ1 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
USP49Q70CQ1 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
USP49Q70CQ1 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
USP49Q70CQ1 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
USP49Q70CQ1 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
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USP49Q70CQ1 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
USP49Q70CQ1 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
USP49Q70CQ1 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
USP49Q70CQ1 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
USP49Q70CQ1 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
USP49Q70CQ1 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
USP49Q70CQ1 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
USP49Q70CQ1 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
USP49Q70CQ1 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
USP49Q70CQ1 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
USP49Q70CQ1 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
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