Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
USF2Q15853 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
USF2Q15853 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
USF2Q15853 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
USF2Q15853 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
USF2Q15853 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
USF2Q15853 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
USF2Q15853 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
USF2Q15853 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
USF2Q15853 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
USF2Q15853 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
USF2Q15853 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
USF2Q15853 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
USF2Q15853 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
USF2Q15853 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
USF2Q15853 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
USF2Q15853 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
USF2Q15853 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
USF2Q15853 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
USF2Q15853 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
USF2Q15853 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
USF2Q15853 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
USF2Q15853 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
USF2Q15853 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
USF2Q15853 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
USF2Q15853 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
USF2Q15853 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
USF2Q15853 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
USF2Q15853 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
USF2Q15853 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
USF2Q15853 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
USF2Q15853 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
USF2Q15853 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
USF2Q15853 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
USF2Q15853 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
USF2Q15853 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
USF2Q15853 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
USF2Q15853 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
USF2Q15853 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
USF2Q15853 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
USF2Q15853 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
USF2Q15853 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
USF2Q15853 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
USF2Q15853 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
USF2Q15853 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
USF2Q15853 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
USF2Q15853 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
USF2Q15853 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
USF2Q15853 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
USF2Q15853 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
USF2Q15853 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
USF2Q15853 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
USF2Q15853 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
USF2Q15853 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
USF2Q15853 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
USF2Q15853 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
USF2Q15853 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
USF2Q15853 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
USF2Q15853 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
USF2Q15853 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
USF2Q15853 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
USF2Q15853 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
USF2Q15853 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
USF2Q15853 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
USF2Q15853 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
USF2Q15853 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
USF2Q15853 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
USF2Q15853 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
USF2Q15853 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
USF2Q15853 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
USF2Q15853 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
USF2Q15853 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
USF2Q15853 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
USF2Q15853 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
USF2Q15853 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
USF2Q15853 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
USF2Q15853 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
USF2Q15853 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
USF2Q15853 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
USF2Q15853 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
USF2Q15853 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
USF2Q15853 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
USF2Q15853 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
USF2Q15853 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
USF2Q15853 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
USF2Q15853 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
USF2Q15853 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
USF2Q15853 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
USF2Q15853 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
USF2Q15853 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
USF2Q15853 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
USF2Q15853 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
USF2Q15853 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
USF2Q15853 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
USF2Q15853 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
USF2Q15853 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
USF2Q15853 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
USF2Q15853 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
USF2Q15853 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
USF2Q15853 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
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