Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-1.26□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC-1.31□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC-1.32□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
NEDD8Q15843 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
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