Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PCOLCEQ15113 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PCOLCEQ15113 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PCOLCEQ15113 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
PCOLCEQ15113 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
PCOLCEQ15113 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.1
PCOLCEQ15113 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PCOLCEQ15113 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.5 ms