Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
R3HDM1Q15032 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
R3HDM1Q15032 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
R3HDM1Q15032 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
R3HDM1Q15032 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
R3HDM1Q15032 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
R3HDM1Q15032 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
R3HDM1Q15032 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
R3HDM1Q15032 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
R3HDM1Q15032 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
R3HDM1Q15032 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
R3HDM1Q15032 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
R3HDM1Q15032 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
R3HDM1Q15032 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
R3HDM1Q15032 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
R3HDM1Q15032 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
R3HDM1Q15032 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
R3HDM1Q15032 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
R3HDM1Q15032 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
R3HDM1Q15032 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
R3HDM1Q15032 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
R3HDM1Q15032 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
R3HDM1Q15032 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
R3HDM1Q15032 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
R3HDM1Q15032 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
R3HDM1Q15032 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
R3HDM1Q15032 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
R3HDM1Q15032 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.06
R3HDM1Q15032 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
R3HDM1Q15032 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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