Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SMCO1Q147U7 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SMCO1Q147U7 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SMCO1Q147U7 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SMCO1Q147U7 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC-2.13□□□□□ -2.75
SMCO1Q147U7 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC-2.13□□□□□ -2.75
SMCO1Q147U7 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SMCO1Q147U7 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SMCO1Q147U7 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SMCO1Q147U7 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
SMCO1Q147U7 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
SMCO1Q147U7 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
SMCO1Q147U7 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
SMCO1Q147U7 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
SMCO1Q147U7 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
SMCO1Q147U7 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
SMCO1Q147U7 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC-2.14□□□□□ -2.75
SMCO1Q147U7 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
SMCO1Q147U7 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SMCO1Q147U7 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SMCO1Q147U7 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SMCO1Q147U7 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SMCO1Q147U7 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SMCO1Q147U7 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC-2.15□□□□□ -2.75
SMCO1Q147U7 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SMCO1Q147U7 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SMCO1Q147U7 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SMCO1Q147U7 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SMCO1Q147U7 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SMCO1Q147U7 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SMCO1Q147U7 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SMCO1Q147U7 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SMCO1Q147U7 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
SMCO1Q147U7 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
SMCO1Q147U7 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
SMCO1Q147U7 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
SMCO1Q147U7 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
SMCO1Q147U7 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
SMCO1Q147U7 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC-2.16□□□□□ -2.76
SMCO1Q147U7 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
SMCO1Q147U7 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
SMCO1Q147U7 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
SMCO1Q147U7 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
SMCO1Q147U7 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
SMCO1Q147U7 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC-2.17□□□□□ -2.76
SMCO1Q147U7 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SMCO1Q147U7 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SMCO1Q147U7 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SMCO1Q147U7 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SMCO1Q147U7 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SMCO1Q147U7 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
SMCO1Q147U7 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
SMCO1Q147U7 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
SMCO1Q147U7 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
SMCO1Q147U7 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC-2.2□□□□□ -2.76
SMCO1Q147U7 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
SMCO1Q147U7 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC-2.2□□□□□ -2.76
SMCO1Q147U7 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
SMCO1Q147U7 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
SMCO1Q147U7 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
SMCO1Q147U7 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
SMCO1Q147U7 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
SMCO1Q147U7 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
SMCO1Q147U7 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
SMCO1Q147U7 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
SMCO1Q147U7 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
SMCO1Q147U7 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
SMCO1Q147U7 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
SMCO1Q147U7 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
SMCO1Q147U7 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
SMCO1Q147U7 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
SMCO1Q147U7 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
SMCO1Q147U7 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SMCO1Q147U7 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SMCO1Q147U7 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SMCO1Q147U7 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SMCO1Q147U7 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SMCO1Q147U7 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SMCO1Q147U7 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SMCO1Q147U7 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SMCO1Q147U7 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SMCO1Q147U7 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SMCO1Q147U7 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC-2.22□□□□□ -2.76
SMCO1Q147U7 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SMCO1Q147U7 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SMCO1Q147U7 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SMCO1Q147U7 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SMCO1Q147U7 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SMCO1Q147U7 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SMCO1Q147U7 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SMCO1Q147U7 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC-2.23□□□□□ -2.77
SMCO1Q147U7 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SMCO1Q147U7 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SMCO1Q147U7 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SMCO1Q147U7 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SMCO1Q147U7 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SMCO1Q147U7 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SMCO1Q147U7 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SMCO1Q147U7 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SMCO1Q147U7 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms