Protein–RNA interactions for Protein: Q14444

CAPRIN1, Caprin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN1Q14444 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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CAPRIN1Q14444 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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CAPRIN1Q14444 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
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CAPRIN1Q14444 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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CAPRIN1Q14444 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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CAPRIN1Q14444 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
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CAPRIN1Q14444 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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CAPRIN1Q14444 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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CAPRIN1Q14444 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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CAPRIN1Q14444 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
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