Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CACNA1SQ13698 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
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