Protein–RNA interactions for Protein: Q13487

SNAPC2, snRNA-activating protein complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC2Q13487 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNAPC2Q13487 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNAPC2Q13487 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNAPC2Q13487 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SNAPC2Q13487 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SNAPC2Q13487 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SNAPC2Q13487 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SNAPC2Q13487 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SNAPC2Q13487 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SNAPC2Q13487 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SNAPC2Q13487 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
SNAPC2Q13487 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SNAPC2Q13487 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SNAPC2Q13487 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
SNAPC2Q13487 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SNAPC2Q13487 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SNAPC2Q13487 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SNAPC2Q13487 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SNAPC2Q13487 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
SNAPC2Q13487 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SNAPC2Q13487 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SNAPC2Q13487 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SNAPC2Q13487 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SNAPC2Q13487 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SNAPC2Q13487 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SNAPC2Q13487 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
SNAPC2Q13487 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SNAPC2Q13487 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SNAPC2Q13487 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SNAPC2Q13487 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SNAPC2Q13487 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SNAPC2Q13487 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SNAPC2Q13487 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SNAPC2Q13487 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SNAPC2Q13487 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SNAPC2Q13487 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SNAPC2Q13487 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SNAPC2Q13487 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SNAPC2Q13487 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SNAPC2Q13487 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SNAPC2Q13487 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SNAPC2Q13487 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SNAPC2Q13487 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SNAPC2Q13487 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SNAPC2Q13487 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SNAPC2Q13487 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SNAPC2Q13487 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SNAPC2Q13487 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SNAPC2Q13487 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SNAPC2Q13487 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SNAPC2Q13487 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SNAPC2Q13487 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SNAPC2Q13487 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SNAPC2Q13487 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SNAPC2Q13487 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SNAPC2Q13487 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SNAPC2Q13487 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SNAPC2Q13487 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SNAPC2Q13487 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SNAPC2Q13487 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SNAPC2Q13487 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SNAPC2Q13487 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SNAPC2Q13487 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SNAPC2Q13487 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNAPC2Q13487 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNAPC2Q13487 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNAPC2Q13487 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNAPC2Q13487 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNAPC2Q13487 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNAPC2Q13487 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNAPC2Q13487 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNAPC2Q13487 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SNAPC2Q13487 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNAPC2Q13487 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNAPC2Q13487 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNAPC2Q13487 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNAPC2Q13487 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNAPC2Q13487 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNAPC2Q13487 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNAPC2Q13487 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNAPC2Q13487 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNAPC2Q13487 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNAPC2Q13487 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNAPC2Q13487 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNAPC2Q13487 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNAPC2Q13487 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNAPC2Q13487 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SNAPC2Q13487 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
SNAPC2Q13487 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SNAPC2Q13487 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNAPC2Q13487 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNAPC2Q13487 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNAPC2Q13487 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SNAPC2Q13487 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNAPC2Q13487 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNAPC2Q13487 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
SNAPC2Q13487 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
SNAPC2Q13487 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNAPC2Q13487 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNAPC2Q13487 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.7 ms