Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FOXE3Q13461 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXE3Q13461 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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