Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
SP140Q13342 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SP140Q13342 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SP140Q13342 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SP140Q13342 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SP140Q13342 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SP140Q13342 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SP140Q13342 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SP140Q13342 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SP140Q13342 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SP140Q13342 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SP140Q13342 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SP140Q13342 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SP140Q13342 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SP140Q13342 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SP140Q13342 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SP140Q13342 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SP140Q13342 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SP140Q13342 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SP140Q13342 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SP140Q13342 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SP140Q13342 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SP140Q13342 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SP140Q13342 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SP140Q13342 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SP140Q13342 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SP140Q13342 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
SP140Q13342 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SP140Q13342 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SP140Q13342 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SP140Q13342 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SP140Q13342 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SP140Q13342 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SP140Q13342 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SP140Q13342 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SP140Q13342 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SP140Q13342 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SP140Q13342 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SP140Q13342 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SP140Q13342 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SP140Q13342 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SP140Q13342 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SP140Q13342 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SP140Q13342 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SP140Q13342 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SP140Q13342 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SP140Q13342 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SP140Q13342 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SP140Q13342 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SP140Q13342 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SP140Q13342 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SP140Q13342 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SP140Q13342 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SP140Q13342 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
SP140Q13342 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SP140Q13342 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SP140Q13342 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SP140Q13342 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SP140Q13342 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SP140Q13342 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SP140Q13342 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SP140Q13342 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SP140Q13342 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SP140Q13342 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SP140Q13342 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SP140Q13342 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SP140Q13342 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SP140Q13342 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SP140Q13342 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SP140Q13342 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SP140Q13342 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SP140Q13342 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SP140Q13342 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SP140Q13342 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SP140Q13342 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SP140Q13342 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SP140Q13342 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SP140Q13342 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SP140Q13342 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SP140Q13342 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SP140Q13342 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SP140Q13342 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SP140Q13342 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SP140Q13342 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SP140Q13342 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SP140Q13342 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SP140Q13342 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SP140Q13342 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SP140Q13342 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SP140Q13342 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SP140Q13342 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SP140Q13342 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SP140Q13342 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SP140Q13342 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SP140Q13342 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SP140Q13342 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
SP140Q13342 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SP140Q13342 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SP140Q13342 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SP140Q13342 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
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