Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTGDRQ13258 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTGDRQ13258 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PTGDRQ13258 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTGDRQ13258 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTGDRQ13258 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTGDRQ13258 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTGDRQ13258 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PTGDRQ13258 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTGDRQ13258 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTGDRQ13258 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTGDRQ13258 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTGDRQ13258 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTGDRQ13258 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PTGDRQ13258 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
PTGDRQ13258 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
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PTGDRQ13258 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTGDRQ13258 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTGDRQ13258 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTGDRQ13258 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTGDRQ13258 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PTGDRQ13258 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTGDRQ13258 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PTGDRQ13258 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTGDRQ13258 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTGDRQ13258 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTGDRQ13258 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTGDRQ13258 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTGDRQ13258 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTGDRQ13258 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
PTGDRQ13258 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
PTGDRQ13258 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
PTGDRQ13258 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PTGDRQ13258 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PTGDRQ13258 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PTGDRQ13258 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PTGDRQ13258 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PTGDRQ13258 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PTGDRQ13258 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PTGDRQ13258 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PTGDRQ13258 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
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PTGDRQ13258 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTGDRQ13258 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTGDRQ13258 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
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PTGDRQ13258 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
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PTGDRQ13258 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTGDRQ13258 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTGDRQ13258 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
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PTGDRQ13258 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
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PTGDRQ13258 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTGDRQ13258 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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PTGDRQ13258 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
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PTGDRQ13258 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTGDRQ13258 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTGDRQ13258 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTGDRQ13258 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTGDRQ13258 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTGDRQ13258 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTGDRQ13258 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTGDRQ13258 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTGDRQ13258 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTGDRQ13258 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTGDRQ13258 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTGDRQ13258 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTGDRQ13258 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTGDRQ13258 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTGDRQ13258 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTGDRQ13258 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.93
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