Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
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ERCC8Q13216 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ERCC8Q13216 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
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ERCC8Q13216 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
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ERCC8Q13216 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
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ERCC8Q13216 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
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ERCC8Q13216 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
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ERCC8Q13216 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ERCC8Q13216 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
ERCC8Q13216 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
ERCC8Q13216 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ERCC8Q13216 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ERCC8Q13216 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ERCC8Q13216 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ERCC8Q13216 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ERCC8Q13216 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ERCC8Q13216 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ERCC8Q13216 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ERCC8Q13216 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
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