Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
NR1H3Q13133 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
NR1H3Q13133 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NR1H3Q13133 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NR1H3Q13133 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NR1H3Q13133 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NR1H3Q13133 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NR1H3Q13133 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NR1H3Q13133 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NR1H3Q13133 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NR1H3Q13133 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
NR1H3Q13133 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NR1H3Q13133 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NR1H3Q13133 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NR1H3Q13133 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NR1H3Q13133 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NR1H3Q13133 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NR1H3Q13133 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NR1H3Q13133 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NR1H3Q13133 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
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