Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NFIAQ12857 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
NFIAQ12857 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
NFIAQ12857 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NFIAQ12857 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NFIAQ12857 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NFIAQ12857 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
NFIAQ12857 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
NFIAQ12857 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NFIAQ12857 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NFIAQ12857 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NFIAQ12857 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NFIAQ12857 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NFIAQ12857 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NFIAQ12857 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NFIAQ12857 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NFIAQ12857 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NFIAQ12857 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NFIAQ12857 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NFIAQ12857 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NFIAQ12857 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
NFIAQ12857 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NFIAQ12857 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
NFIAQ12857 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
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NFIAQ12857 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NFIAQ12857 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NFIAQ12857 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NFIAQ12857 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NFIAQ12857 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
NFIAQ12857 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NFIAQ12857 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NFIAQ12857 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NFIAQ12857 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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NFIAQ12857 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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NFIAQ12857 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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NFIAQ12857 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NFIAQ12857 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NFIAQ12857 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NFIAQ12857 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NFIAQ12857 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NFIAQ12857 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NFIAQ12857 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NFIAQ12857 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NFIAQ12857 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
NFIAQ12857 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
NFIAQ12857 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
NFIAQ12857 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NFIAQ12857 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NFIAQ12857 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NFIAQ12857 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NFIAQ12857 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
NFIAQ12857 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NFIAQ12857 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NFIAQ12857 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NFIAQ12857 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NFIAQ12857 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NFIAQ12857 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NFIAQ12857 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NFIAQ12857 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
NFIAQ12857 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NFIAQ12857 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NFIAQ12857 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NFIAQ12857 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NFIAQ12857 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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