Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ACTBP60709 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ACTBP60709 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ACTBP60709 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ACTBP60709 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ACTBP60709 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ACTBP60709 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ACTBP60709 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ACTBP60709 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ACTBP60709 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ACTBP60709 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ACTBP60709 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ACTBP60709 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ACTBP60709 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ACTBP60709 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ACTBP60709 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ACTBP60709 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ACTBP60709 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ACTBP60709 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ACTBP60709 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ACTBP60709 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ACTBP60709 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ACTBP60709 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ACTBP60709 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ACTBP60709 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ACTBP60709 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ACTBP60709 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ACTBP60709 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ACTBP60709 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ACTBP60709 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ACTBP60709 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ACTBP60709 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ACTBP60709 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ACTBP60709 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ACTBP60709 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ACTBP60709 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ACTBP60709 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ACTBP60709 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ACTBP60709 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ACTBP60709 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ACTBP60709 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ACTBP60709 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ACTBP60709 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ACTBP60709 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
ACTBP60709 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ACTBP60709 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ACTBP60709 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ACTBP60709 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ACTBP60709 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
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ACTBP60709 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
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ACTBP60709 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
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ACTBP60709 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ACTBP60709 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ACTBP60709 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
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ACTBP60709 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ACTBP60709 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ACTBP60709 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ACTBP60709 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
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ACTBP60709 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
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ACTBP60709 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ACTBP60709 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ACTBP60709 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ACTBP60709 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ACTBP60709 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ACTBP60709 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ACTBP60709 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
ACTBP60709 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
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