Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
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CENPFP49454 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
CENPFP49454 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
CENPFP49454 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC-3.3□□□□□ -2.94
CENPFP49454 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
CENPFP49454 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
CENPFP49454 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC-3.3□□□□□ -2.94
CENPFP49454 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
CENPFP49454 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
CENPFP49454 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
CENPFP49454 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
CENPFP49454 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
CENPFP49454 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC-3.31□□□□□ -2.94
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CENPFP49454 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
CENPFP49454 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
CENPFP49454 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
CENPFP49454 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
CENPFP49454 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
CENPFP49454 Y_RNA.137-201ENST00000363455 112 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
CENPFP49454 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
CENPFP49454 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
CENPFP49454 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
CENPFP49454 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
CENPFP49454 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
CENPFP49454 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
CENPFP49454 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
CENPFP49454 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
CENPFP49454 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC-3.33□□□□□ -2.94
CENPFP49454 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
CENPFP49454 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
CENPFP49454 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
CENPFP49454 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC-3.33□□□□□ -2.94
CENPFP49454 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
CENPFP49454 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
CENPFP49454 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
CENPFP49454 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
CENPFP49454 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
CENPFP49454 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
CENPFP49454 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
CENPFP49454 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
CENPFP49454 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
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CENPFP49454 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
CENPFP49454 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
CENPFP49454 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC-3.34□□□□□ -2.94
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CENPFP49454 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC-3.35□□□□□ -2.95
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CENPFP49454 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
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CENPFP49454 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
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CENPFP49454 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
CENPFP49454 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
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CENPFP49454 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
CENPFP49454 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
CENPFP49454 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
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