Protein–RNA interactions for Protein: P28289

TMOD1, Tropomodulin-1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1P28289 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TMOD1P28289 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TMOD1P28289 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TMOD1P28289 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TMOD1P28289 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TMOD1P28289 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TMOD1P28289 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TMOD1P28289 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TMOD1P28289 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC0.33□□□□□ -2.36
TMOD1P28289 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TMOD1P28289 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TMOD1P28289 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TMOD1P28289 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TMOD1P28289 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TMOD1P28289 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TMOD1P28289 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TMOD1P28289 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TMOD1P28289 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TMOD1P28289 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TMOD1P28289 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TMOD1P28289 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TMOD1P28289 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TMOD1P28289 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TMOD1P28289 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TMOD1P28289 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TMOD1P28289 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
TMOD1P28289 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TMOD1P28289 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TMOD1P28289 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TMOD1P28289 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TMOD1P28289 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TMOD1P28289 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TMOD1P28289 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TMOD1P28289 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TMOD1P28289 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TMOD1P28289 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TMOD1P28289 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TMOD1P28289 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TMOD1P28289 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TMOD1P28289 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TMOD1P28289 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TMOD1P28289 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
TMOD1P28289 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TMOD1P28289 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.29□□□□□ -2.36
TMOD1P28289 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TMOD1P28289 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TMOD1P28289 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TMOD1P28289 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TMOD1P28289 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TMOD1P28289 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TMOD1P28289 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.28□□□□□ -2.36
TMOD1P28289 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
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TMOD1P28289 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TMOD1P28289 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TMOD1P28289 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TMOD1P28289 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TMOD1P28289 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TMOD1P28289 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TMOD1P28289 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TMOD1P28289 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TMOD1P28289 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TMOD1P28289 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TMOD1P28289 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TMOD1P28289 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TMOD1P28289 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TMOD1P28289 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TMOD1P28289 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
TMOD1P28289 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TMOD1P28289 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TMOD1P28289 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TMOD1P28289 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
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