Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
J3KRW8 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
J3KRW8 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
J3KRW8 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
J3KRW8 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
J3KRW8 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
J3KRW8 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
J3KRW8 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
J3KRW8 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
J3KRW8 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
J3KRW8 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
J3KRW8 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
J3KRW8 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
J3KRW8 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
J3KRW8 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
J3KRW8 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
J3KRW8 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
J3KRW8 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
J3KRW8 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
J3KRW8 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
J3KRW8 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
J3KRW8 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
J3KRW8 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
J3KRW8 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
J3KRW8 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
J3KRW8 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
J3KRW8 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
J3KRW8 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
J3KRW8 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
J3KRW8 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
J3KRW8 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
J3KRW8 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
J3KRW8 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
J3KRW8 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
J3KRW8 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
J3KRW8 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
J3KRW8 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
J3KRW8 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
J3KRW8 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
J3KRW8 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
J3KRW8 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
J3KRW8 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
J3KRW8 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
J3KRW8 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
J3KRW8 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
J3KRW8 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
J3KRW8 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
J3KRW8 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
J3KRW8 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
J3KRW8 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
J3KRW8 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
J3KRW8 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
J3KRW8 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
J3KRW8 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
J3KRW8 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
J3KRW8 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
J3KRW8 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
J3KRW8 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
J3KRW8 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
J3KRW8 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
J3KRW8 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
J3KRW8 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
J3KRW8 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
J3KRW8 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
J3KRW8 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
J3KRW8 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
J3KRW8 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
J3KRW8 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
J3KRW8 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
J3KRW8 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
J3KRW8 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
J3KRW8 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
J3KRW8 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
J3KRW8 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
J3KRW8 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
J3KRW8 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
J3KRW8 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
J3KRW8 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
J3KRW8 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
J3KRW8 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
J3KRW8 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
J3KRW8 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
J3KRW8 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
J3KRW8 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
J3KRW8 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
J3KRW8 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
J3KRW8 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
J3KRW8 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
J3KRW8 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
J3KRW8 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
J3KRW8 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
J3KRW8 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
J3KRW8 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
J3KRW8 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
J3KRW8 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
J3KRW8 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
J3KRW8 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
J3KRW8 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
J3KRW8 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
J3KRW8 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 2622.1 ms