Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CIPCQ9C0C6 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CIPCQ9C0C6 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CIPCQ9C0C6 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
CIPCQ9C0C6 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CIPCQ9C0C6 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CIPCQ9C0C6 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CIPCQ9C0C6 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CIPCQ9C0C6 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CIPCQ9C0C6 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CIPCQ9C0C6 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CIPCQ9C0C6 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CIPCQ9C0C6 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CIPCQ9C0C6 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CIPCQ9C0C6 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CIPCQ9C0C6 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CIPCQ9C0C6 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CIPCQ9C0C6 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CIPCQ9C0C6 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CIPCQ9C0C6 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CIPCQ9C0C6 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CIPCQ9C0C6 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CIPCQ9C0C6 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
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