Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
SMG1Q96Q15 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
SMG1Q96Q15 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
SMG1Q96Q15 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
SMG1Q96Q15 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
SMG1Q96Q15 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
SMG1Q96Q15 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
SMG1Q96Q15 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC-1.87□□□□□ -2.71
SMG1Q96Q15 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
SMG1Q96Q15 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC-1.87□□□□□ -2.71
SMG1Q96Q15 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC-1.87□□□□□ -2.71
SMG1Q96Q15 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
SMG1Q96Q15 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
SMG1Q96Q15 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
SMG1Q96Q15 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
SMG1Q96Q15 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
SMG1Q96Q15 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
SMG1Q96Q15 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
SMG1Q96Q15 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
SMG1Q96Q15 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
SMG1Q96Q15 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
SMG1Q96Q15 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
SMG1Q96Q15 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
SMG1Q96Q15 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
SMG1Q96Q15 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
SMG1Q96Q15 AL731768.1-201ENST00000603124 139 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
SMG1Q96Q15 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SMG1Q96Q15 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC-1.89□□□□□ -2.71
SMG1Q96Q15 Y_RNA.652-201ENST00000458902 102 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SMG1Q96Q15 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SMG1Q96Q15 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SMG1Q96Q15 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SMG1Q96Q15 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SMG1Q96Q15 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SMG1Q96Q15 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SMG1Q96Q15 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SMG1Q96Q15 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC-1.89□□□□□ -2.71
SMG1Q96Q15 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SMG1Q96Q15 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SMG1Q96Q15 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SMG1Q96Q15 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SMG1Q96Q15 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SMG1Q96Q15 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
SMG1Q96Q15 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
SMG1Q96Q15 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
SMG1Q96Q15 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
SMG1Q96Q15 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
SMG1Q96Q15 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
SMG1Q96Q15 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
SMG1Q96Q15 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
SMG1Q96Q15 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
SMG1Q96Q15 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
SMG1Q96Q15 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
SMG1Q96Q15 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
SMG1Q96Q15 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
SMG1Q96Q15 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.71
SMG1Q96Q15 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC-1.91□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC-1.93□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC-1.94□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC-1.95□□□□□ -2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.4 ms