Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TPRNQ4KMQ1 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TPRNQ4KMQ1 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TPRNQ4KMQ1 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TPRNQ4KMQ1 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TPRNQ4KMQ1 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TPRNQ4KMQ1 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TPRNQ4KMQ1 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TPRNQ4KMQ1 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TPRNQ4KMQ1 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TPRNQ4KMQ1 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TPRNQ4KMQ1 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TPRNQ4KMQ1 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TPRNQ4KMQ1 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TPRNQ4KMQ1 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TPRNQ4KMQ1 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TPRNQ4KMQ1 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TPRNQ4KMQ1 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TPRNQ4KMQ1 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TPRNQ4KMQ1 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TPRNQ4KMQ1 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TPRNQ4KMQ1 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TPRNQ4KMQ1 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TPRNQ4KMQ1 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TPRNQ4KMQ1 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TPRNQ4KMQ1 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TPRNQ4KMQ1 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TPRNQ4KMQ1 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TPRNQ4KMQ1 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TPRNQ4KMQ1 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TPRNQ4KMQ1 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TPRNQ4KMQ1 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TPRNQ4KMQ1 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TPRNQ4KMQ1 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TPRNQ4KMQ1 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TPRNQ4KMQ1 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TPRNQ4KMQ1 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TPRNQ4KMQ1 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
TPRNQ4KMQ1 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TPRNQ4KMQ1 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TPRNQ4KMQ1 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TPRNQ4KMQ1 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TPRNQ4KMQ1 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TPRNQ4KMQ1 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TPRNQ4KMQ1 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TPRNQ4KMQ1 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
TPRNQ4KMQ1 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
TPRNQ4KMQ1 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TPRNQ4KMQ1 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TPRNQ4KMQ1 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TPRNQ4KMQ1 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TPRNQ4KMQ1 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TPRNQ4KMQ1 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TPRNQ4KMQ1 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TPRNQ4KMQ1 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TPRNQ4KMQ1 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TPRNQ4KMQ1 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TPRNQ4KMQ1 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TPRNQ4KMQ1 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TPRNQ4KMQ1 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TPRNQ4KMQ1 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
TPRNQ4KMQ1 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TPRNQ4KMQ1 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TPRNQ4KMQ1 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TPRNQ4KMQ1 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TPRNQ4KMQ1 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
TPRNQ4KMQ1 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TPRNQ4KMQ1 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TPRNQ4KMQ1 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TPRNQ4KMQ1 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TPRNQ4KMQ1 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TPRNQ4KMQ1 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TPRNQ4KMQ1 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TPRNQ4KMQ1 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TPRNQ4KMQ1 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TPRNQ4KMQ1 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TPRNQ4KMQ1 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TPRNQ4KMQ1 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TPRNQ4KMQ1 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
TPRNQ4KMQ1 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
TPRNQ4KMQ1 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
TPRNQ4KMQ1 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TPRNQ4KMQ1 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TPRNQ4KMQ1 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TPRNQ4KMQ1 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TPRNQ4KMQ1 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TPRNQ4KMQ1 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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