Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CDKN3Q16667 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
CDKN3Q16667 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CDKN3Q16667 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.3 ms