Protein–RNA interactions for Protein: Q16650

TBR1, T-box brain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBR1Q16650 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TBR1Q16650 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TBR1Q16650 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TBR1Q16650 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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