Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SLC18A3Q16572 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SLC18A3Q16572 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SLC18A3Q16572 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SLC18A3Q16572 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SLC18A3Q16572 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SLC18A3Q16572 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SLC18A3Q16572 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SLC18A3Q16572 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SLC18A3Q16572 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SLC18A3Q16572 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SLC18A3Q16572 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SLC18A3Q16572 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
SLC18A3Q16572 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SLC18A3Q16572 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SLC18A3Q16572 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SLC18A3Q16572 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SLC18A3Q16572 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SLC18A3Q16572 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SLC18A3Q16572 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SLC18A3Q16572 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SLC18A3Q16572 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SLC18A3Q16572 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SLC18A3Q16572 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SLC18A3Q16572 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SLC18A3Q16572 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SLC18A3Q16572 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SLC18A3Q16572 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SLC18A3Q16572 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SLC18A3Q16572 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SLC18A3Q16572 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SLC18A3Q16572 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SLC18A3Q16572 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SLC18A3Q16572 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SLC18A3Q16572 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SLC18A3Q16572 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SLC18A3Q16572 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SLC18A3Q16572 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SLC18A3Q16572 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SLC18A3Q16572 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SLC18A3Q16572 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SLC18A3Q16572 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SLC18A3Q16572 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SLC18A3Q16572 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SLC18A3Q16572 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SLC18A3Q16572 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SLC18A3Q16572 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SLC18A3Q16572 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SLC18A3Q16572 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SLC18A3Q16572 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SLC18A3Q16572 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SLC18A3Q16572 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SLC18A3Q16572 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SLC18A3Q16572 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SLC18A3Q16572 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SLC18A3Q16572 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SLC18A3Q16572 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SLC18A3Q16572 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SLC18A3Q16572 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SLC18A3Q16572 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SLC18A3Q16572 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
SLC18A3Q16572 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
SLC18A3Q16572 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SLC18A3Q16572 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SLC18A3Q16572 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SLC18A3Q16572 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SLC18A3Q16572 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SLC18A3Q16572 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SLC18A3Q16572 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SLC18A3Q16572 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SLC18A3Q16572 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SLC18A3Q16572 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SLC18A3Q16572 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SLC18A3Q16572 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SLC18A3Q16572 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SLC18A3Q16572 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SLC18A3Q16572 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SLC18A3Q16572 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SLC18A3Q16572 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SLC18A3Q16572 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SLC18A3Q16572 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SLC18A3Q16572 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SLC18A3Q16572 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SLC18A3Q16572 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SLC18A3Q16572 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SLC18A3Q16572 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SLC18A3Q16572 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SLC18A3Q16572 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SLC18A3Q16572 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SLC18A3Q16572 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SLC18A3Q16572 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SLC18A3Q16572 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SLC18A3Q16572 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SLC18A3Q16572 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SLC18A3Q16572 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SLC18A3Q16572 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SLC18A3Q16572 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SLC18A3Q16572 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SLC18A3Q16572 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SLC18A3Q16572 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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