Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CNGA3Q16281 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
CNGA3Q16281 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
CNGA3Q16281 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
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