Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
E2F4Q16254 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
E2F4Q16254 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
E2F4Q16254 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
E2F4Q16254 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
E2F4Q16254 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
E2F4Q16254 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
E2F4Q16254 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
E2F4Q16254 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
E2F4Q16254 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
E2F4Q16254 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
E2F4Q16254 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
E2F4Q16254 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
E2F4Q16254 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
E2F4Q16254 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
E2F4Q16254 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
E2F4Q16254 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
E2F4Q16254 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
E2F4Q16254 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
E2F4Q16254 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
E2F4Q16254 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
E2F4Q16254 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
E2F4Q16254 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
E2F4Q16254 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
E2F4Q16254 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
E2F4Q16254 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
E2F4Q16254 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
E2F4Q16254 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
E2F4Q16254 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
E2F4Q16254 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
E2F4Q16254 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
E2F4Q16254 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
E2F4Q16254 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
E2F4Q16254 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
E2F4Q16254 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
E2F4Q16254 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
E2F4Q16254 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
E2F4Q16254 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
E2F4Q16254 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
E2F4Q16254 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
E2F4Q16254 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
E2F4Q16254 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
E2F4Q16254 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
E2F4Q16254 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
E2F4Q16254 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
E2F4Q16254 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
E2F4Q16254 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
E2F4Q16254 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
E2F4Q16254 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
E2F4Q16254 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
E2F4Q16254 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
E2F4Q16254 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
E2F4Q16254 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
E2F4Q16254 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
E2F4Q16254 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
E2F4Q16254 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
E2F4Q16254 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
E2F4Q16254 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
E2F4Q16254 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
E2F4Q16254 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
E2F4Q16254 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
E2F4Q16254 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
E2F4Q16254 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
E2F4Q16254 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
E2F4Q16254 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
E2F4Q16254 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
E2F4Q16254 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
E2F4Q16254 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
E2F4Q16254 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
E2F4Q16254 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
E2F4Q16254 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
E2F4Q16254 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
E2F4Q16254 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
E2F4Q16254 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
E2F4Q16254 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
E2F4Q16254 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
E2F4Q16254 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
E2F4Q16254 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
E2F4Q16254 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
E2F4Q16254 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
E2F4Q16254 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
E2F4Q16254 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
E2F4Q16254 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
E2F4Q16254 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
E2F4Q16254 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
E2F4Q16254 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
E2F4Q16254 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
E2F4Q16254 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
E2F4Q16254 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
E2F4Q16254 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
E2F4Q16254 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
E2F4Q16254 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
E2F4Q16254 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
E2F4Q16254 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
E2F4Q16254 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
E2F4Q16254 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
E2F4Q16254 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
E2F4Q16254 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
E2F4Q16254 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
E2F4Q16254 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 261 ms