Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC-1.21□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC-1.22□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
NEDD8Q15843 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC-1.25□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
NEDD8Q15843 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
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