Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CCDC85BQ15834 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC85BQ15834 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC85BQ15834 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC85BQ15834 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC85BQ15834 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC85BQ15834 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC85BQ15834 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CCDC85BQ15834 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC85BQ15834 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC85BQ15834 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC85BQ15834 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC85BQ15834 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC85BQ15834 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC85BQ15834 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC85BQ15834 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC85BQ15834 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC85BQ15834 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC85BQ15834 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CCDC85BQ15834 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC85BQ15834 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC85BQ15834 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC85BQ15834 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC85BQ15834 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC85BQ15834 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CCDC85BQ15834 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC85BQ15834 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC85BQ15834 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC85BQ15834 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC85BQ15834 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC85BQ15834 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC85BQ15834 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC85BQ15834 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC85BQ15834 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC85BQ15834 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CCDC85BQ15834 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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