Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TLR1Q15399 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TLR1Q15399 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TLR1Q15399 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TLR1Q15399 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TLR1Q15399 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TLR1Q15399 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TLR1Q15399 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TLR1Q15399 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
TLR1Q15399 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TLR1Q15399 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
TLR1Q15399 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TLR1Q15399 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TLR1Q15399 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TLR1Q15399 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TLR1Q15399 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TLR1Q15399 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TLR1Q15399 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TLR1Q15399 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TLR1Q15399 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.97
TLR1Q15399 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TLR1Q15399 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
TLR1Q15399 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TLR1Q15399 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TLR1Q15399 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.1 ms