Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NECTIN1Q15223 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.25
NECTIN1Q15223 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NECTIN1Q15223 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NECTIN1Q15223 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NECTIN1Q15223 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NECTIN1Q15223 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NECTIN1Q15223 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NECTIN1Q15223 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NECTIN1Q15223 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NECTIN1Q15223 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NECTIN1Q15223 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NECTIN1Q15223 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NECTIN1Q15223 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NECTIN1Q15223 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NECTIN1Q15223 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NECTIN1Q15223 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NECTIN1Q15223 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NECTIN1Q15223 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NECTIN1Q15223 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NECTIN1Q15223 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NECTIN1Q15223 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NECTIN1Q15223 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NECTIN1Q15223 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NECTIN1Q15223 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NECTIN1Q15223 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NECTIN1Q15223 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NECTIN1Q15223 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NECTIN1Q15223 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NECTIN1Q15223 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NECTIN1Q15223 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NECTIN1Q15223 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NECTIN1Q15223 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NECTIN1Q15223 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NECTIN1Q15223 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NECTIN1Q15223 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NECTIN1Q15223 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NECTIN1Q15223 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
NECTIN1Q15223 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NECTIN1Q15223 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
NECTIN1Q15223 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
NECTIN1Q15223 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
NECTIN1Q15223 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NECTIN1Q15223 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NECTIN1Q15223 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NECTIN1Q15223 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NECTIN1Q15223 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NECTIN1Q15223 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NECTIN1Q15223 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NECTIN1Q15223 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NECTIN1Q15223 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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