Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HERC3Q15034 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HERC3Q15034 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HERC3Q15034 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
HERC3Q15034 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERC3Q15034 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERC3Q15034 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERC3Q15034 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERC3Q15034 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERC3Q15034 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERC3Q15034 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERC3Q15034 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERC3Q15034 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HERC3Q15034 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HERC3Q15034 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HERC3Q15034 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HERC3Q15034 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HERC3Q15034 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HERC3Q15034 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HERC3Q15034 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HERC3Q15034 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HERC3Q15034 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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