Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SQLEQ14534 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
SQLEQ14534 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SQLEQ14534 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SQLEQ14534 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SQLEQ14534 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
SQLEQ14534 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SQLEQ14534 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SQLEQ14534 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SQLEQ14534 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
SQLEQ14534 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SQLEQ14534 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SQLEQ14534 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SQLEQ14534 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SQLEQ14534 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SQLEQ14534 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SQLEQ14534 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SQLEQ14534 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SQLEQ14534 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SQLEQ14534 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SQLEQ14534 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SQLEQ14534 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SQLEQ14534 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SQLEQ14534 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SQLEQ14534 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SQLEQ14534 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SQLEQ14534 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SQLEQ14534 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SQLEQ14534 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SQLEQ14534 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SQLEQ14534 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SQLEQ14534 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SQLEQ14534 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SQLEQ14534 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SQLEQ14534 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SQLEQ14534 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SQLEQ14534 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SQLEQ14534 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SQLEQ14534 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SQLEQ14534 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SQLEQ14534 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SQLEQ14534 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SQLEQ14534 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SQLEQ14534 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SQLEQ14534 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
SQLEQ14534 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
SQLEQ14534 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SQLEQ14534 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SQLEQ14534 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SQLEQ14534 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SQLEQ14534 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SQLEQ14534 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SQLEQ14534 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SQLEQ14534 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SQLEQ14534 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SQLEQ14534 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SQLEQ14534 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SQLEQ14534 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SQLEQ14534 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SQLEQ14534 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SQLEQ14534 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SQLEQ14534 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SQLEQ14534 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SQLEQ14534 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SQLEQ14534 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SQLEQ14534 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SQLEQ14534 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SQLEQ14534 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SQLEQ14534 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SQLEQ14534 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SQLEQ14534 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SQLEQ14534 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SQLEQ14534 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SQLEQ14534 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SQLEQ14534 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SQLEQ14534 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SQLEQ14534 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SQLEQ14534 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
SQLEQ14534 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SQLEQ14534 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SQLEQ14534 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SQLEQ14534 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SQLEQ14534 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SQLEQ14534 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SQLEQ14534 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SQLEQ14534 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SQLEQ14534 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SQLEQ14534 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
SQLEQ14534 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SQLEQ14534 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SQLEQ14534 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SQLEQ14534 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SQLEQ14534 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SQLEQ14534 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SQLEQ14534 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SQLEQ14534 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SQLEQ14534 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SQLEQ14534 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
SQLEQ14534 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SQLEQ14534 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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