Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

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Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CACNA1CQ13936 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.54□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CACNA1CQ13936 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
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