Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC-1.95□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC-1.95□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC-1.95□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC-1.95□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC-1.96□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC-1.96□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC-1.96□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 RNU6-1128P-201ENST00000362825 109 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
SPTAN1Q13813 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC-1.97□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 Y_RNA.520-201ENST00000384556 102 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC-1.98□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC-1.99□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC-2.01□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 SNORD114-13-201ENST00000364377 74 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
SPTAN1Q13813 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
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