Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
CACNA1SQ13698 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CACNA1SQ13698 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
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