Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.93□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
CDH18Q13634 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CDH18Q13634 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 203.5 ms