Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
KRR1Q13601 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
KRR1Q13601 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
KRR1Q13601 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
KRR1Q13601 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
KRR1Q13601 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
KRR1Q13601 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
KRR1Q13601 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
KRR1Q13601 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
KRR1Q13601 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
KRR1Q13601 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
KRR1Q13601 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
KRR1Q13601 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
KRR1Q13601 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
KRR1Q13601 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
KRR1Q13601 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
KRR1Q13601 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
KRR1Q13601 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
KRR1Q13601 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
KRR1Q13601 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
KRR1Q13601 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
KRR1Q13601 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
KRR1Q13601 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC-1.1□□□□□ -2.59
KRR1Q13601 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
KRR1Q13601 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC-1.1□□□□□ -2.59
KRR1Q13601 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
KRR1Q13601 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
KRR1Q13601 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
KRR1Q13601 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
KRR1Q13601 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
KRR1Q13601 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
KRR1Q13601 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
KRR1Q13601 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
KRR1Q13601 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
KRR1Q13601 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
KRR1Q13601 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
KRR1Q13601 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
KRR1Q13601 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
KRR1Q13601 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC-1.11□□□□□ -2.59
KRR1Q13601 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
KRR1Q13601 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
KRR1Q13601 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
KRR1Q13601 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
KRR1Q13601 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
KRR1Q13601 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
KRR1Q13601 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
KRR1Q13601 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
KRR1Q13601 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
KRR1Q13601 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
KRR1Q13601 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
KRR1Q13601 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
KRR1Q13601 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
KRR1Q13601 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
KRR1Q13601 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
KRR1Q13601 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
KRR1Q13601 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
KRR1Q13601 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
KRR1Q13601 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
KRR1Q13601 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
KRR1Q13601 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
KRR1Q13601 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
KRR1Q13601 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
KRR1Q13601 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
KRR1Q13601 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
KRR1Q13601 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
KRR1Q13601 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
KRR1Q13601 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
KRR1Q13601 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
KRR1Q13601 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
KRR1Q13601 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC-1.15□□□□□ -2.59
KRR1Q13601 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC-1.15□□□□□ -2.59
KRR1Q13601 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
KRR1Q13601 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
KRR1Q13601 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
KRR1Q13601 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
KRR1Q13601 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
KRR1Q13601 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
KRR1Q13601 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
KRR1Q13601 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
KRR1Q13601 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
KRR1Q13601 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
KRR1Q13601 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.16□□□□□ -2.6
KRR1Q13601 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC-1.16□□□□□ -2.6
KRR1Q13601 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
KRR1Q13601 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
KRR1Q13601 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
KRR1Q13601 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
KRR1Q13601 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
KRR1Q13601 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
KRR1Q13601 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
KRR1Q13601 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
KRR1Q13601 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
KRR1Q13601 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
KRR1Q13601 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
KRR1Q13601 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
KRR1Q13601 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
KRR1Q13601 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
KRR1Q13601 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
KRR1Q13601 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
KRR1Q13601 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
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