Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SP140Q13342 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SP140Q13342 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SP140Q13342 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SP140Q13342 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SP140Q13342 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
SP140Q13342 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
SP140Q13342 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SP140Q13342 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SP140Q13342 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SP140Q13342 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SP140Q13342 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SP140Q13342 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
SP140Q13342 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
SP140Q13342 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SP140Q13342 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SP140Q13342 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SP140Q13342 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SP140Q13342 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SP140Q13342 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SP140Q13342 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SP140Q13342 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
SP140Q13342 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
SP140Q13342 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SP140Q13342 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SP140Q13342 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SP140Q13342 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SP140Q13342 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SP140Q13342 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SP140Q13342 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
SP140Q13342 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SP140Q13342 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SP140Q13342 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SP140Q13342 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SP140Q13342 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SP140Q13342 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SP140Q13342 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SP140Q13342 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SP140Q13342 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SP140Q13342 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SP140Q13342 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SP140Q13342 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SP140Q13342 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SP140Q13342 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SP140Q13342 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SP140Q13342 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SP140Q13342 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SP140Q13342 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SP140Q13342 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SP140Q13342 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SP140Q13342 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SP140Q13342 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SP140Q13342 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SP140Q13342 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SP140Q13342 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SP140Q13342 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SP140Q13342 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SP140Q13342 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SP140Q13342 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SP140Q13342 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SP140Q13342 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SP140Q13342 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SP140Q13342 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SP140Q13342 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SP140Q13342 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SP140Q13342 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SP140Q13342 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SP140Q13342 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SP140Q13342 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SP140Q13342 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SP140Q13342 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SP140Q13342 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SP140Q13342 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SP140Q13342 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SP140Q13342 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SP140Q13342 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SP140Q13342 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SP140Q13342 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SP140Q13342 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SP140Q13342 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SP140Q13342 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SP140Q13342 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SP140Q13342 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SP140Q13342 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SP140Q13342 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SP140Q13342 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SP140Q13342 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SP140Q13342 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SP140Q13342 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SP140Q13342 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SP140Q13342 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SP140Q13342 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SP140Q13342 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SP140Q13342 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SP140Q13342 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SP140Q13342 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SP140Q13342 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SP140Q13342 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SP140Q13342 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
SP140Q13342 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.1 ms