| PTK7 | Q13308 | Y_RNA.354-201 | ENST00000365448 | 111 nt | BASIC | 2.67 | □□□□□ -1.98 | | |
| PTK7 | Q13308 | DEFA7P-201 | ENST00000382676 | 285 nt | BASIC | 2.67 | □□□□□ -1.98 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU6-970P-201 | ENST00000516312 | 107 nt | BASIC | 2.67 | □□□□□ -1.98 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU6ATAC12P-201 | ENST00000516542 | 115 nt | BASIC | 2.67 | □□□□□ -1.98 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC046143.2-201 | ENST00000609789 | 160 nt | BASIC | 2.67 | □□□□□ -1.98 | | |
| PTK7 | Q13308 | MIR6895-201 | ENST00000613497 | 78 nt | BASIC | 2.67 | □□□□□ -1.98 | | |
| PTK7 | Q13308 | SPTSSB-205 | ENST00000620149 | 231 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.67 | □□□□□ -1.98 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC008133.2-201 | ENST00000624540 | 351 nt | BASIC | 2.67 | □□□□□ -1.98 | | |
| PTK7 | Q13308 | MIR1291-201 | ENST00000627649 | 87 nt | BASIC | 2.67 | □□□□□ -1.98 | | |
| PTK7 | Q13308 | AGTPBP1-205 | ENST00000376083 | 4208 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNA5SP276-201 | ENST00000362580 | 94 nt | BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU4-36P-201 | ENST00000364294 | 144 nt | BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| PTK7 | Q13308 | AL451046.2-201 | ENST00000403074 | 277 nt | BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| PTK7 | Q13308 | ATP6V0E1P1-201 | ENST00000412537 | 226 nt | BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU6-917P-201 | ENST00000516294 | 104 nt | BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
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| PTK7 | Q13308 | AL035078.1-202 | ENST00000531627 | 413 nt | TSL 2 BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| PTK7 | Q13308 | AL513534.2-201 | ENST00000603836 | 250 nt | BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC095038.3-201 | ENST00000634439 | 195 nt | BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| PTK7 | Q13308 | DENND4A-202 | ENST00000443035 | 8665 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.66 | □□□□□ -1.98 | | |
| PTK7 | Q13308 | ASPM-202 | ENST00000367408 | 3747 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.98 | | |
| PTK7 | Q13308 | Y_RNA.155-201 | ENST00000363632 | 101 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| PTK7 | Q13308 | MIR194-1-201 | ENST00000384892 | 85 nt | BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
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| PTK7 | Q13308 | DYNC2H1-202 | ENST00000375735 | 13678 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 2.65 | □□□□□ -1.99 | | |
| PTK7 | Q13308 | BRCA1-202 | ENST00000354071 | 4497 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| PTK7 | Q13308 | Y_RNA.348-201 | ENST00000365403 | 103 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNA5SP259-201 | ENST00000365541 | 109 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU6-409P-201 | ENST00000384114 | 104 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU6-1190P-201 | ENST00000410811 | 104 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU6-1258P-201 | ENST00000516911 | 111 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| PTK7 | Q13308 | MIR2052-201 | ENST00000636055 | 55 nt | BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| PTK7 | Q13308 | SLC4A7-201 | ENST00000295736 | 7757 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 2.64 | □□□□□ -1.99 | | |
| PTK7 | Q13308 | UHMK1-204 | ENST00000545294 | 8117 nt | TSL 2 BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU6-363P-201 | ENST00000362895 | 105 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| PTK7 | Q13308 | MIR590-201 | ENST00000385008 | 97 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| PTK7 | Q13308 | MIR513A1-201 | ENST00000385138 | 129 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| PTK7 | Q13308 | MIR653-201 | ENST00000385279 | 96 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
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| PTK7 | Q13308 | GHRL-208 | ENST00000439975 | 326 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| PTK7 | Q13308 | DEFB131E-201 | ENST00000532329 | 154 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| PTK7 | Q13308 | MIR548AE2-201 | ENST00000583456 | 67 nt | BASIC | 2.63 | □□□□□ -1.99 | | |
| PTK7 | Q13308 | PCM1-222 | ENST00000524226 | 5955 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| PTK7 | Q13308 | Y_RNA.10-201 | ENST00000362371 | 110 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU4-67P-201 | ENST00000364569 | 141 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| PTK7 | Q13308 | Y_RNA.470-201 | ENST00000384307 | 117 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU6-905P-201 | ENST00000384434 | 107 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU6-733P-201 | ENST00000410759 | 104 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU6-904P-201 | ENST00000516206 | 101 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| PTK7 | Q13308 | MIR5694-201 | ENST00000581190 | 76 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| PTK7 | Q13308 | MIR8055-201 | ENST00000610739 | 97 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| PTK7 | Q13308 | ZNFX1-AS1_2.1-201 | ENST00000610973 | 93 nt | BASIC | 2.62 | □□□□□ -1.99 | | |
| PTK7 | Q13308 | MIR6073-201 | ENST00000352083 | 89 nt | BASIC | 2.61 | □□□□□ -1.99 | | |
| PTK7 | Q13308 | ATP13A3-201 | ENST00000256031 | 7322 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| PTK7 | Q13308 | HMGN1P33-201 | ENST00000432945 | 451 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| PTK7 | Q13308 | CYP3A52P-201 | ENST00000563326 | 91 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
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| PTK7 | Q13308 | MIR4769-201 | ENST00000584126 | 77 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| PTK7 | Q13308 | Y_RNA.773-201 | ENST00000607168 | 90 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| PTK7 | Q13308 | AL773524.1-201 | ENST00000614065 | 229 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| PTK7 | Q13308 | MIR1255B1-201 | ENST00000636325 | 63 nt | BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| PTK7 | Q13308 | DNAH14-210 | ENST00000439375 | 13548 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.6 | □□□□□ -1.99 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU6-640P-201 | ENST00000363693 | 105 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| PTK7 | Q13308 | SNORD73B-201 | ENST00000364394 | 72 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC244636.1-201 | ENST00000421152 | 228 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU6-109P-201 | ENST00000516364 | 107 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU6-184P-201 | ENST00000516514 | 107 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU6-158P-201 | ENST00000517104 | 100 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC025887.1-201 | ENST00000578349 | 264 nt | TSL 3 BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| PTK7 | Q13308 | MIR4694-201 | ENST00000578534 | 80 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| PTK7 | Q13308 | MIR5007-201 | ENST00000583098 | 95 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| PTK7 | Q13308 | MIR4251-201 | ENST00000635819 | 61 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| PTK7 | Q13308 | Z97988.1-201 | ENST00000637697 | 135 nt | BASIC | 2.59 | □□□□□ -1.99 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNY3P2-201 | ENST00000362918 | 102 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNA5SP181-201 | ENST00000410246 | 98 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| PTK7 | Q13308 | SNORA19.1-201 | ENST00000410656 | 129 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| PTK7 | Q13308 | AL161935.2-201 | ENST00000414627 | 60 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| PTK7 | Q13308 | snoU13.23-201 | ENST00000458863 | 104 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC067747.1-201 | ENST00000608026 | 250 nt | BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| PTK7 | Q13308 | TRAJ36-201 | ENST00000614481 | 58 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| PTK7 | Q13308 | KIF20B-202 | ENST00000371728 | 6419 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.58 | □□□□□ -2 | | |
| PTK7 | Q13308 | FGF7-201 | ENST00000267843 | 5467 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| PTK7 | Q13308 | SNORD114-1-201 | ENST00000362705 | 72 nt | BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| PTK7 | Q13308 | SNORA32-201 | ENST00000384072 | 121 nt | BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| PTK7 | Q13308 | MIR144-201 | ENST00000384886 | 86 nt | BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| PTK7 | Q13308 | TRAJ23-201 | ENST00000390514 | 63 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC245047.7-201 | ENST00000440265 | 293 nt | BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC108752.1-201 | ENST00000484679 | 576 nt | TSL 5 BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| PTK7 | Q13308 | MIR3935-201 | ENST00000583472 | 104 nt | BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| PTK7 | Q13308 | AL357312.1-201 | ENST00000603879 | 298 nt | BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| PTK7 | Q13308 | MIR6873-201 | ENST00000622788 | 63 nt | BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| PTK7 | Q13308 | TTK-202 | ENST00000369798 | 3010 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 2.57 | □□□□□ -2 | | |
| PTK7 | Q13308 | XIRP2-201 | ENST00000295237 | 5246 nt | TSL 2 BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |
| PTK7 | Q13308 | Y_RNA.93-201 | ENST00000363066 | 109 nt | BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |
| PTK7 | Q13308 | Y_RNA.107-201 | ENST00000363190 | 121 nt | BASIC | 2.56 | □□□□□ -2 | | |