Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CHAF1BQ13112 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
CHAF1BQ13112 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC0.74□□□□□ -2.29
CHAF1BQ13112 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CHAF1BQ13112 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CHAF1BQ13112 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CHAF1BQ13112 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CHAF1BQ13112 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CHAF1BQ13112 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CHAF1BQ13112 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CHAF1BQ13112 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CHAF1BQ13112 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
CHAF1BQ13112 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CHAF1BQ13112 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CHAF1BQ13112 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CHAF1BQ13112 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CHAF1BQ13112 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CHAF1BQ13112 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CHAF1BQ13112 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CHAF1BQ13112 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CHAF1BQ13112 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CHAF1BQ13112 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CHAF1BQ13112 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CHAF1BQ13112 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CHAF1BQ13112 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.73□□□□□ -2.29
CHAF1BQ13112 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CHAF1BQ13112 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CHAF1BQ13112 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CHAF1BQ13112 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CHAF1BQ13112 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CHAF1BQ13112 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CHAF1BQ13112 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CHAF1BQ13112 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CHAF1BQ13112 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CHAF1BQ13112 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CHAF1BQ13112 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CHAF1BQ13112 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CHAF1BQ13112 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CHAF1BQ13112 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CHAF1BQ13112 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CHAF1BQ13112 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CHAF1BQ13112 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CHAF1BQ13112 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CHAF1BQ13112 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CHAF1BQ13112 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CHAF1BQ13112 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CHAF1BQ13112 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CHAF1BQ13112 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CHAF1BQ13112 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CHAF1BQ13112 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CHAF1BQ13112 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CHAF1BQ13112 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CHAF1BQ13112 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CHAF1BQ13112 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CHAF1BQ13112 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CHAF1BQ13112 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CHAF1BQ13112 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CHAF1BQ13112 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CHAF1BQ13112 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CHAF1BQ13112 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CHAF1BQ13112 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CHAF1BQ13112 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CHAF1BQ13112 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CHAF1BQ13112 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CHAF1BQ13112 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CHAF1BQ13112 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
CHAF1BQ13112 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CHAF1BQ13112 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CHAF1BQ13112 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CHAF1BQ13112 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CHAF1BQ13112 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CHAF1BQ13112 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CHAF1BQ13112 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CHAF1BQ13112 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CHAF1BQ13112 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
CHAF1BQ13112 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CHAF1BQ13112 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CHAF1BQ13112 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CHAF1BQ13112 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CHAF1BQ13112 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CHAF1BQ13112 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CHAF1BQ13112 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CHAF1BQ13112 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CHAF1BQ13112 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CHAF1BQ13112 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CHAF1BQ13112 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CHAF1BQ13112 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CHAF1BQ13112 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
CHAF1BQ13112 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CHAF1BQ13112 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CHAF1BQ13112 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CHAF1BQ13112 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CHAF1BQ13112 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CHAF1BQ13112 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CHAF1BQ13112 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CHAF1BQ13112 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CHAF1BQ13112 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.65□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CHAF1BQ13112 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
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