Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GRIK2Q13002 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GRIK2Q13002 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GRIK2Q13002 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GRIK2Q13002 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GRIK2Q13002 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIK2Q13002 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIK2Q13002 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIK2Q13002 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIK2Q13002 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIK2Q13002 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIK2Q13002 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIK2Q13002 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIK2Q13002 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIK2Q13002 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIK2Q13002 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIK2Q13002 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIK2Q13002 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIK2Q13002 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIK2Q13002 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIK2Q13002 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIK2Q13002 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIK2Q13002 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIK2Q13002 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIK2Q13002 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIK2Q13002 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIK2Q13002 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIK2Q13002 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIK2Q13002 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIK2Q13002 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIK2Q13002 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIK2Q13002 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIK2Q13002 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIK2Q13002 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIK2Q13002 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
GRIK2Q13002 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIK2Q13002 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIK2Q13002 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIK2Q13002 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIK2Q13002 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIK2Q13002 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIK2Q13002 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIK2Q13002 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIK2Q13002 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIK2Q13002 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIK2Q13002 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
GRIK2Q13002 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GRIK2Q13002 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GRIK2Q13002 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
GRIK2Q13002 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GRIK2Q13002 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GRIK2Q13002 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GRIK2Q13002 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GRIK2Q13002 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
GRIK2Q13002 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
GRIK2Q13002 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
GRIK2Q13002 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIK2Q13002 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIK2Q13002 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIK2Q13002 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIK2Q13002 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIK2Q13002 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIK2Q13002 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIK2Q13002 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIK2Q13002 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIK2Q13002 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIK2Q13002 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIK2Q13002 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIK2Q13002 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIK2Q13002 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIK2Q13002 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIK2Q13002 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIK2Q13002 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIK2Q13002 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIK2Q13002 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIK2Q13002 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIK2Q13002 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIK2Q13002 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIK2Q13002 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIK2Q13002 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIK2Q13002 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIK2Q13002 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIK2Q13002 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIK2Q13002 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIK2Q13002 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIK2Q13002 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GRIK2Q13002 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GRIK2Q13002 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GRIK2Q13002 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GRIK2Q13002 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GRIK2Q13002 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GRIK2Q13002 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GRIK2Q13002 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GRIK2Q13002 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GRIK2Q13002 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GRIK2Q13002 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GRIK2Q13002 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GRIK2Q13002 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GRIK2Q13002 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
GRIK2Q13002 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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