Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
BNIP3Q12983 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
BNIP3Q12983 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
BNIP3Q12983 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
BNIP3Q12983 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
BNIP3Q12983 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
BNIP3Q12983 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
BNIP3Q12983 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
BNIP3Q12983 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
BNIP3Q12983 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
BNIP3Q12983 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
BNIP3Q12983 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
BNIP3Q12983 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
BNIP3Q12983 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
BNIP3Q12983 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
BNIP3Q12983 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
BNIP3Q12983 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
BNIP3Q12983 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
BNIP3Q12983 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
BNIP3Q12983 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
BNIP3Q12983 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
BNIP3Q12983 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
BNIP3Q12983 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
BNIP3Q12983 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
BNIP3Q12983 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
BNIP3Q12983 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
BNIP3Q12983 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
BNIP3Q12983 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
BNIP3Q12983 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
BNIP3Q12983 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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BNIP3Q12983 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
BNIP3Q12983 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
BNIP3Q12983 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
BNIP3Q12983 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
BNIP3Q12983 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
BNIP3Q12983 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
BNIP3Q12983 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
BNIP3Q12983 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
BNIP3Q12983 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
BNIP3Q12983 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
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BNIP3Q12983 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
BNIP3Q12983 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
BNIP3Q12983 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
BNIP3Q12983 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
BNIP3Q12983 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
BNIP3Q12983 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
BNIP3Q12983 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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BNIP3Q12983 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
BNIP3Q12983 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
BNIP3Q12983 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
BNIP3Q12983 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
BNIP3Q12983 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
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BNIP3Q12983 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BNIP3Q12983 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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BNIP3Q12983 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BNIP3Q12983 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BNIP3Q12983 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
BNIP3Q12983 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
BNIP3Q12983 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
BNIP3Q12983 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
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BNIP3Q12983 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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BNIP3Q12983 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
BNIP3Q12983 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
BNIP3Q12983 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
BNIP3Q12983 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
BNIP3Q12983 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
BNIP3Q12983 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
BNIP3Q12983 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
BNIP3Q12983 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
BNIP3Q12983 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
BNIP3Q12983 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
BNIP3Q12983 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
BNIP3Q12983 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
BNIP3Q12983 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
BNIP3Q12983 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
BNIP3Q12983 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
BNIP3Q12983 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
BNIP3Q12983 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
BNIP3Q12983 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
BNIP3Q12983 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
BNIP3Q12983 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
BNIP3Q12983 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
BNIP3Q12983 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
BNIP3Q12983 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
BNIP3Q12983 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
BNIP3Q12983 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
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