Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
GTF3C1Q12789 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
GTF3C1Q12789 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC0.69□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
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GTF3C1Q12789 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
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GTF3C1Q12789 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
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GTF3C1Q12789 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.67□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
GTF3C1Q12789 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
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