Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CSO75390 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CSO75390 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CSO75390 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CSO75390 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CSO75390 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CSO75390 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CSO75390 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CSO75390 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CSO75390 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CSO75390 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CSO75390 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CSO75390 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CSO75390 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CSO75390 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CSO75390 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CSO75390 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CSO75390 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CSO75390 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CSO75390 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CSO75390 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CSO75390 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CSO75390 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CSO75390 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
CSO75390 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CSO75390 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC0.67□□□□□ -2.3
CSO75390 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CSO75390 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CSO75390 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CSO75390 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC0.67□□□□□ -2.3
CSO75390 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CSO75390 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CSO75390 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CSO75390 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CSO75390 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CSO75390 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CSO75390 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CSO75390 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CSO75390 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CSO75390 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CSO75390 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CSO75390 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CSO75390 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CSO75390 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CSO75390 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CSO75390 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CSO75390 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CSO75390 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CSO75390 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CSO75390 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
CSO75390 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CSO75390 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CSO75390 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CSO75390 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC0.64□□□□□ -2.31
CSO75390 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CSO75390 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CSO75390 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
CSO75390 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CSO75390 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CSO75390 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CSO75390 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CSO75390 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CSO75390 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
CSO75390 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CSO75390 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CSO75390 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CSO75390 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CSO75390 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CSO75390 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CSO75390 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CSO75390 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CSO75390 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CSO75390 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CSO75390 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CSO75390 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CSO75390 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CSO75390 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CSO75390 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CSO75390 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CSO75390 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.63□□□□□ -2.31
CSO75390 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
CSO75390 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.62□□□□□ -2.31
CSO75390 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CSO75390 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CSO75390 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CSO75390 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CSO75390 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CSO75390 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CSO75390 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CSO75390 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CSO75390 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CSO75390 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
CSO75390 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CSO75390 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CSO75390 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CSO75390 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CSO75390 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CSO75390 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CSO75390 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CSO75390 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107 ms