Protein–RNA interactions for Protein: O14817

TSPAN4, Tetraspanin-4, humanhuman

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4O14817 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TSPAN4O14817 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TSPAN4O14817 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TSPAN4O14817 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
TSPAN4O14817 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TSPAN4O14817 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TSPAN4O14817 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TSPAN4O14817 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
TSPAN4O14817 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TSPAN4O14817 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TSPAN4O14817 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TSPAN4O14817 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TSPAN4O14817 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TSPAN4O14817 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TSPAN4O14817 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TSPAN4O14817 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TSPAN4O14817 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TSPAN4O14817 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TSPAN4O14817 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TSPAN4O14817 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TSPAN4O14817 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TSPAN4O14817 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TSPAN4O14817 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TSPAN4O14817 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TSPAN4O14817 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TSPAN4O14817 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TSPAN4O14817 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
TSPAN4O14817 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TSPAN4O14817 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TSPAN4O14817 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TSPAN4O14817 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
TSPAN4O14817 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TSPAN4O14817 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TSPAN4O14817 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TSPAN4O14817 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TSPAN4O14817 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TSPAN4O14817 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TSPAN4O14817 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TSPAN4O14817 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TSPAN4O14817 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TSPAN4O14817 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TSPAN4O14817 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
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TSPAN4O14817 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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TSPAN4O14817 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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TSPAN4O14817 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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TSPAN4O14817 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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TSPAN4O14817 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
TSPAN4O14817 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TSPAN4O14817 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TSPAN4O14817 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TSPAN4O14817 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TSPAN4O14817 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TSPAN4O14817 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TSPAN4O14817 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TSPAN4O14817 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TSPAN4O14817 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TSPAN4O14817 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TSPAN4O14817 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TSPAN4O14817 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TSPAN4O14817 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
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