Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
USP17L12C9JPN9 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
USP17L12C9JPN9 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USP17L12C9JPN9 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USP17L12C9JPN9 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USP17L12C9JPN9 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USP17L12C9JPN9 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USP17L12C9JPN9 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USP17L12C9JPN9 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
USP17L12C9JPN9 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
USP17L12C9JPN9 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USP17L12C9JPN9 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USP17L12C9JPN9 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USP17L12C9JPN9 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USP17L12C9JPN9 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USP17L12C9JPN9 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
USP17L12C9JPN9 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USP17L12C9JPN9 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USP17L12C9JPN9 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USP17L12C9JPN9 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USP17L12C9JPN9 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
USP17L12C9JPN9 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
USP17L12C9JPN9 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
USP17L12C9JPN9 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
USP17L12C9JPN9 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
USP17L12C9JPN9 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
USP17L12C9JPN9 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
USP17L12C9JPN9 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
USP17L12C9JPN9 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
USP17L12C9JPN9 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
USP17L12C9JPN9 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
USP17L12C9JPN9 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
USP17L12C9JPN9 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
USP17L12C9JPN9 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
USP17L12C9JPN9 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
USP17L12C9JPN9 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
USP17L12C9JPN9 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
USP17L12C9JPN9 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
USP17L12C9JPN9 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
USP17L12C9JPN9 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
USP17L12C9JPN9 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
USP17L12C9JPN9 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
USP17L12C9JPN9 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
USP17L12C9JPN9 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
USP17L12C9JPN9 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
USP17L12C9JPN9 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
USP17L12C9JPN9 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
USP17L12C9JPN9 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
USP17L12C9JPN9 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
USP17L12C9JPN9 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
USP17L12C9JPN9 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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USP17L12C9JPN9 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USP17L12C9JPN9 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USP17L12C9JPN9 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USP17L12C9JPN9 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USP17L12C9JPN9 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
USP17L12C9JPN9 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USP17L12C9JPN9 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USP17L12C9JPN9 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USP17L12C9JPN9 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USP17L12C9JPN9 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USP17L12C9JPN9 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USP17L12C9JPN9 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USP17L12C9JPN9 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
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USP17L12C9JPN9 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USP17L12C9JPN9 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USP17L12C9JPN9 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USP17L12C9JPN9 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USP17L12C9JPN9 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USP17L12C9JPN9 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USP17L12C9JPN9 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USP17L12C9JPN9 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USP17L12C9JPN9 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USP17L12C9JPN9 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USP17L12C9JPN9 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USP17L12C9JPN9 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
USP17L12C9JPN9 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
USP17L12C9JPN9 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
USP17L12C9JPN9 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USP17L12C9JPN9 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USP17L12C9JPN9 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USP17L12C9JPN9 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USP17L12C9JPN9 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USP17L12C9JPN9 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.56□□□□□ -2
USP17L12C9JPN9 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
USP17L12C9JPN9 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
USP17L12C9JPN9 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USP17L12C9JPN9 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USP17L12C9JPN9 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USP17L12C9JPN9 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
USP17L12C9JPN9 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USP17L12C9JPN9 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
USP17L12C9JPN9 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USP17L12C9JPN9 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USP17L12C9JPN9 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USP17L12C9JPN9 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.55□□□□□ -2
USP17L12C9JPN9 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
USP17L12C9JPN9 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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