Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,791 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC-2.05□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC-2.07□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC-2.08□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC-2.09□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC-2.1□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
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